PyMOL - Download

好东西

着色系统是 PyMOL 真正出彩的地方。您可以使用一个命令突出显示特定的残基，例如催化位点中的所有组氨酸。我使用“按链”颜色选项来分隔复合物中的子单元，突然之间，结构不再只是一个斑点。咔哒一声。还有测量工具？超级精确。我根据公布的值仔细检查了键长和角度，结果完全匹配。此外，Python 脚本也改变了游戏规则。我编写了一个快速脚本来自动从不同角度生成蛋白质的侧视图，节省了我的时间。导出选项支持 PNG、PDF，甚至动画，因此您可以轻松地将它们放入幻灯片或报告中。

不太好的

好吧，让我们面对现实吧——界面一开始是……令人生畏的。当你打开它时，感觉就像你没有穿实验服走进了某人的实验室。没有手牵着。但老实说，一旦你研究了 15 分钟，它就开始有意义了。尽管如此，初学者可能会迷失方向，除非他们遵循教程。没有真正有用的内置帮助菜单 - 只是假设您已经知道“卡通”表示是什么的文档链接。虽然它是免费的，但学习曲线意味着它不太适合休闲使用。如果您只想查看一次分子并继续前进，ArgusLab（也是免费的）可能会更友好。另外，它没有针对触摸屏或低端机器进行优化——我的旧笔记本电脑在繁重的渲染过程中会出现卡顿的情况。

底线

如果您从事教育、研究或分子生物学工作，PyMOL - Windows 版下载绝对值得购买。它是免费的，包含大多数应用程序收费的工具，并且输出质量是一流的。只是期望花一些时间来弄清楚。对于任何认真研究蛋白质或小分子的人来说，它是最好的免费工具之一。仅当您只是浏览或需要非常简单的东西时才跳过它。否则？继续下载吧。以后你会感谢自己的。